Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms