Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms