Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms