Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GscQ02591 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GscQ02591 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms