Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Top2aQ01320 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms