Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms