Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yy1Q00899 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Yy1Q00899 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yy1Q00899 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yy1Q00899 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Yy1Q00899 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yy1Q00899 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yy1Q00899 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Yy1Q00899 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yy1Q00899 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yy1Q00899 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yy1Q00899 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yy1Q00899 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yy1Q00899 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yy1Q00899 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms