Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms