Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms