Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SgcdP82347 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SgcdP82347 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SgcdP82347 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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SgcdP82347 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SgcdP82347 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SgcdP82347 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SgcdP82347 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SgcdP82347 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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SgcdP82347 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SgcdP82347 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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