Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx3P70354 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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