Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb13P70321 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb13P70321 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms