Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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