Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp46P62069 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp46P62069 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp46P62069 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp46P62069 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp46P62069 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp46P62069 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp46P62069 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp46P62069 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp46P62069 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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