Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
GferP56213 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GferP56213 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GferP56213 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms