Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms