Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtbrP50284 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtbrP50284 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LtbrP50284 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LtbrP50284 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LtbrP50284 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LtbrP50284 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LtbrP50284 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LtbrP50284 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LtbrP50284 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LtbrP50284 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LtbrP50284 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LtbrP50284 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbrP50284 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbrP50284 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LtbrP50284 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LtbrP50284 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbrP50284 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbrP50284 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbrP50284 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LtbrP50284 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbrP50284 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LtbrP50284 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LtbrP50284 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LtbrP50284 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms