Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LmnaP48678 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LmnaP48678 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms