Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab11bP46638 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms