Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkn1bP46414 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms