Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VhlP40338 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VhlP40338 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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