Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtlP38585 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtlP38585 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms