Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms