Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rom1P32958 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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