Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms