Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RxraP28700 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxraP28700 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxraP28700 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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