Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NapbP28663 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NapbP28663 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NapbP28663 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NapbP28663 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NapbP28663 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NapbP28663 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NapbP28663 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NapbP28663 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NapbP28663 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NapbP28663 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NapbP28663 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NapbP28663 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NapbP28663 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms