Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms