Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms