Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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