Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkchP23298 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkchP23298 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms