Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tap1P21958 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms