Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcer1aP20489 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms