Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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