Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P20040 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P20040 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms