Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NefhP19246 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NefhP19246 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NefhP19246 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NefhP19246 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NefhP19246 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NefhP19246 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NefhP19246 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms