Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ifrd1P19182 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifrd1P19182 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms