Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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