Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcnaP17918 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PcnaP17918 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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