Protein–RNA interactions for Protein: P14115

Rpl27a, 60S ribosomal protein L27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27aP14115 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl27aP14115 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms