Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms