Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP11369 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP11369 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP11369 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP11369 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP11369 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP11369 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP11369 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP11369 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP11369 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP11369 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP11369 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP11369 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP11369 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP11369 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP11369 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP11369 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP11369 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP11369 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms