Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.4 ms