Protein–RNA interactions for Protein: P02301

H3f3c, Histone H3.3C, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3cP02301 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3cP02301 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms