Protein–RNA interactions for Protein: P01646

Ig kappa chain V-V region HP 123E6, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01646 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01646 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01646 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01646 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01646 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01646 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01646 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
P01646 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
P01646 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01646 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01646 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01646 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01646 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01646 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01646 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01646 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01646 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01646 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01646 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01646 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01646 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01646 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms