Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rdh16O54909 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rdh16O54909 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rdh16O54909 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rdh16O54909 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rdh16O54909 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rdh16O54909 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rdh16O54909 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rdh16O54909 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rdh16O54909 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rdh16O54909 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rdh16O54909 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh16O54909 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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