Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sdc4O35988 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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