Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Gm12691-202ENSMUST00000222516 918 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lhx8O35652 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms