Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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