Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6bO35451 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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